第二代高通量测序/转录组测序/基因组测序/转录因子结合位点的检

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第二代高通量测序/转录组测序/基因组测序/转录因子结合位点的检测/特定区域测序/目标序列捕获测序/甲基化测序ChIP-seq 测序服务


威斯腾生物是一家从事生命科学研究、产品开发和技术服务的专业机构。目前主要从事基因诊断试剂的研发以及生物医学相关领域科研项目承接。经过多年努力现在已拥有多个在全国领先的服务平台,分别为分子生物学检测平台、蛋白组学研发平台、慢病毒与腺病毒生产平台、基因芯片检测平台、动物实验和细胞实验服务平台、鸭乙肝新药筛选平台、病理学检测平台、MicroRNA研发平台、分子靶向用药筛选平台。

本平台的高通量测序是依托上海复旦大学生命科学院,华中师范大学生命科学院,中国国家南方基因组研究中心,做为测序平台。专业,专注,高效,一对一解析和量身设计,让您的课题可以真正达到您的需要。我们的数据分析团队是来自哈佛和生物信息学的科学家为您进行数据分析。让您的科研数据有更高的利用价值。

高通量测序(High-Throughput Sequencing)又名下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS),是相对于传统的桑格测序(Sanger Sequencing)而言的。高通量测序是DNA测序发展历程的一个里程碑,可一次对几十万到几百万条 DNA 分子进行序列测定,因其具有可对完全序列未知的样本进行直接测序的特点,使得研究者对一个物种的转录组和基因组进行细致全面的分析成为可能,所以又被称为深度测序 (deep sequencing) 。目前高通量测序的主要平台代表有罗氏公司(Roche)的454测序仪(Roch GS FLX sequencer),Illumina公司的Solexa基因组分析仪(Illumina Genome Analyzer)和ABI的SOLiD测序仪(ABI SOLiD sequencer)。 

随着高通量测序技术的迅猛发展,NGS技术开始越来越多地被应用来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novosequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序(whole transcriptome resequencing),从而开展可变剪接、编码序列单核苷酸多态性(cSNP)等研究;或者进行小分子RNA测序(small RNA sequencing),通过分离特定大小的RNA分子进行测序,从而发现新的microRNA分子。在转录组水平上,与染色质免疫共沉淀(ChIP)和甲基化DNA免疫共沉淀(MeDIP)技术相结合,从而检测出与特定转录因子结合的DNA区域和基因组上的甲基化位点。

一、威斯腾测序平台:

基于创新的 Illumina 的 Hiseq2000 、 Genome AnalyzerIIx 与 Roche 454 的高通量测序平台,威斯腾生物可帮助您对样本的 microRNA 、 mRNA 、 ncRNA 或 DNA 在进行各种预处理 ( 片段化与建库 ) 后进行高通量的测序。根据样本 RNA 或者 DNA 的不同应用可分为转录组测序、 microRNA测序、 ncRNA测  序、基因组测序等。

二、服务种类:

1、基因组测序

1)人类基因组重测序

2)动植物基因组测序(de novo)及重测序

3)细菌基因组测序(de novo)及重测序

4)真菌基因组测序(de novo)及重测序

2、转录组测序

1)真核转录组

2)细菌转录组

3)数字表达谱分析

4)MicroRNA测序

5)降解组测序分析

3、转录因子结合位点的检测

4、特定区域测序

5、目标序列捕获测序

6、ChIP-seq 测序服务  

7、甲基化测序

三、服务内容:

1、基因组测序: 

全新物种基因组测序:对全新的微生物、植物或动物物种基因组进行整体揭示,包括片段测序、序列组装、基因预测与注释等环节,可以从整体水平对目标物种进行研究。  

基因组重测序:全基因组重测序是对已知基因组序列的物种的个体进行测序,并在个体或群体水平进行差异分析的方法。如微生物的不同菌株、不同疾病患者、不同表型个体等的基因组测定及与已有标准基因组进行比较分析。 

2、转录组测序: 

特定组织或者细胞中的 mRNA 经分离后制备成片段化的 cDNA 文库,通过 Illimina 测序仪对 cDNA 文库高通量测序,从而获得一个细胞或生物个体的全转录组信息,用于寻找差异表达基因与可能的新的可变剪接形式。

3、microRNA 与 ncRNA 测序 : 

可对细胞或者组织中的全部 Small RNA 或 Noncoding RNA 进行深度测序及定量分析。用于作用靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、表达谱分析、miRNA 或 ncRNA 聚类等科学应用。 

四、实验步骤及品控

1、实验步骤(以基因组测序为例): 

实验方案确定

基因组DNA的随机打断

DNA片段的末端修复

修饰,末端加上接头(adapter)

PCR扩增连上接头的DNA片段

文库检测

DNA的成簇扩增

上机测序

生物信息组装/分析

2、品质保证:  

1)全程采用 Illumina 或 Roche 标准试剂;  

2)严格各环节质控,包括 RNA 电泳、基于 Nanodrop 与 Angilent Bioanalyzer 的 RNA 分析、库指标、测序数据质量等  

3)按客户需求严格保证数据总量与质量,并配以完备的数据分析服务。  

五、样品要求:

1、动物、植物、微生物组织:

    提供足量的新鲜柔嫩部位样品;新鲜程度要求:采样后将样品立即液氮速冻-80℃保存(保存期不超过1个月),干冰运输,样本保存期间切忌反复冻融。

2、RNA样品

  总RNA>500ug,浓度>1ug/ul;

六、威斯腾实验服务流程


七、威斯腾生物服务项目

分子生物学检测蛋白质与免疫学动物实验 实时荧光定量PCR单克隆抗体制备帕金森疾病模型 免疫共沉淀(Co-IP)多克隆抗体制备抑郁症动物模型 ELISA(酶联免疫吸附法)技术Western-blot 实验服务脊髓损伤模型 生化指标检测蛋白双向电泳实验服务脑外损伤模型 双荧光素酶报告基因检测原核蛋白表达纯化骨神经损伤模型 染色质免疫共沉淀(ChIP)真核蛋白表达纯化心肌缺血模型 GST pull DownITRAQ定量蛋白质组学心力衰竭模型 SLAC蛋白组学肺动脉高血压动物模型 高血压模型 病毒包装实验课题整体外包粥样动脉硬化模型 过表达/干扰慢病毒包装纯化整体课题外包大脑中动脉阻塞模型 过表达/干扰腺病毒包装纯化细胞整体实验外包慢性之气管炎模型 逆转录病毒包装纯化动物整体实验外包过敏性哮喘模型 腺相关病毒包装纯化肺炎大鼠模型 肝炎-肝硬化-肝癌模型 蛋白芯片原代细胞培养肝纤维化模型 细胞因子芯片骨髓间充质干细胞培养胆结石模型 BioPlex悬浮芯片脂肪干细胞培养急性胰腺炎模型 生长因子芯片心肌成纤维细胞培养急性肾衰竭模型 炎症因子芯片软骨细胞培养体内血栓模型 血管生成因子芯片血管内皮细胞培养关节炎模型 凋亡因子芯片神经元细胞培养I型和II型糖尿病模型 趋化因子芯片内皮组细胞原代培养裸鼠成瘤 HuProt TM 20K人类蛋白组芯片基因编辑动物 电生理相关服务动物整体实验服务 膜片钳实验 细胞生物学检测高通量测序代谢组学 细胞原代培养mRNA测序气相色谱GC/MS MTT检测LncRNA测序液相色谱LC/MS 细胞凋亡检测全基因组测序核磁共震NMR 细胞周期检测RNA-Seq测序 细胞克隆形成实验外显子测序影像学相关实验 Transwell细胞迁移/侵袭16s扩增子测序Micro-CT 流式分选Small RNA测序小动物活体成像 CCK8/XTT检测宏基因组测序核磁共振 台盼蓝检测细胞活性单细胞测序PET-CT 药物筛选细胞学实验circleRNA测序 细胞粘附性检测甲基化测序基因编辑动物 细胞划痕实验条件性敲除小鼠/大鼠 细胞生物学整体实验全基因敲除小鼠/大鼠 细胞成管实验 病理检测CRISPR/Cas9细胞敲除/敲入基因芯片 扫描电镜基因定点突变细胞系LncRNA芯片 透射电镜单基因敲除细胞系miRNA芯片 HE染色多基因敲除细胞系mRNA芯片 免疫组化目的基因敲入细胞系甲基化芯片(限人和小鼠来源样本) Tunel(原位末端凋亡法)检测报告基因敲入细胞系SNP芯片(限人和小鼠来源样本) 激光共聚焦miRNA/LncRNA敲除细胞系 免疫荧光 Masson染色CRISPR/Cas9动物敲除/敲入科研设计指导&文章评估/润色 原位杂交基因敲除大鼠/小鼠科研文献论著翻译 荧光原位杂交基因敲入大鼠/小鼠论文翻译润色服务 特殊染色(PSA、茜素红、阿尔新蓝等)临床实验/科研实验设计方案指导 行为学检测药物筛选服务项目药效学评价 旷场实验高通量自动药物筛选平台抗肿瘤药物药效学评价 重复性刻板行为检测细胞高内涵药物筛选平台心血管系统药物药效学评价 动物跑台检测蛋白质组学靶标研发平台泌尿系统药物药效学评价 强迫游泳分子药理研究平台内分泌系统药物药效学评价 生物膜片钳药物筛选平台抗炎免疫药物药效学评价 常规药物体外筛选

【本平台合作项目】
分子生物学、细胞生物学、基因敲出/入、模式动物、SPF动物保种、病理学检测、免疫学检测、影像学检测、原代培养、细胞药筛、CRISPR/Cas9基因编辑、基因芯片、高通量测序、蛋白组学、代谢组学、高通量高内涵筛选、药效学评价、药理毒理学实验、慢病毒包装与稳转株建立、SiRNA与纳米载药、ChIP、CO-IP、生物信息学分析、知识产权服务! 
【全国免费热线】400-675-6758
【电话】 023-65316016,023-65316556
【邮箱】 china-western@163.com
【官网网址】www.cqwestern.com
【地址】 重庆市高新区二郎创业大道高科创业园D栋2楼

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